Un extraterrestre destructeur qui menace la Terre devient professeur d'une classe dont les élèves ont pour mission de le supprimer, alors même qu'ils adorent sa drôlerie..
Saison d'épisodes spéciaux, ils peuvent soit présenter une nouvelle aventure, soit en retracer une ancienne....
Une créature aux airs de pieuvre s'apprête à détruire la Terre et ne pourra être arrêtée que par les étudiants auxquels elle enseigne l'art du meurtre....
C'est une rentrée très spéciale qui commence, car à la fin de cette année scolaire, Koro-sensei détruira le monde si les élèves de 3E ne le tuent pas avant....